BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Asclepias_curassavica_genome_v1.0.fasta 213 sequences; 206,076,041 total letters Query= HiC_scaffold_13:9178601-9181400 Length=2800 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value HiC_scaffold_13 5171 0.0 HiC_scaffold_1 86.1 7e-15 >HiC_scaffold_13 Length=18851256 Score = 5171 bits (2800), Expect = 0.0 Identities = 2800/2800 (100%), Gaps = 0/2800 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTCTATAATAACACACATTTATAATATGCTTTTTCATGGCGATAATTTAGGGGTTTTTTC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9178601 TTCTATAATAACACACATTTATAATATGCTTTTTCATGGCGATAATTTAGGGGTTTTTTC 9178660 Query 61 GGCTGTCGGAATAAAGGGGTGGTGGATGGAAGAAGAAGATGGTGGATACTGTGTATCATT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9178661 GGCTGTCGGAATAAAGGGGTGGTGGATGGAAGAAGAAGATGGTGGATACTGTGTATCATT 9178720 Query 121 TAAGAGCTTAGCTGTCTACAATATTAGCTTTAGCACAAAAAAGCCTTTAGGTATCTGTCT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9178721 TAAGAGCTTAGCTGTCTACAATATTAGCTTTAGCACAAAAAAGCCTTTAGGTATCTGTCT 9178780 Query 181 CTACATTCTGATTACTTACCATAAATATTGCCTTATTTGTTTTGGTAAGCATAATTTCTA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9178781 CTACATTCTGATTACTTACCATAAATATTGCCTTATTTGTTTTGGTAAGCATAATTTCTA 9178840 Query 241 TAAATATATTCTTACATAGAAATAAATAATTTTAAATATGGAAAGTGCTTTATGTCACAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9178841 TAAATATATTCTTACATAGAAATAAATAATTTTAAATATGGAAAGTGCTTTATGTCACAT 9178900 Query 301 TTAAAACATGACTAAATAAATAATTTCACAATCTTATAACATAAAATCAGATAATGTTAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9178901 TTAAAACATGACTAAATAAATAATTTCACAATCTTATAACATAAAATCAGATAATGTTAT 9178960 Query 361 TATTTTTAAAGTTATAAATAAAATTGAAGTTTTAATAAAATATAAGTTTTTTAAATAATA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9178961 TATTTTTAAAGTTATAAATAAAATTGAAGTTTTAATAAAATATAAGTTTTTTAAATAATA 9179020 Query 421 CCTAATATTAGAAAAAAAAAGTTATTTATTCAAATAAAAATAATAAAGATTAAAAAATGA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179021 CCTAATATTAGAAAAAAAAAGTTATTTATTCAAATAAAAATAATAAAGATTAAAAAATGA 9179080 Query 481 TAAAATTAAAAATTATATGTAATTGAATAAAATTTAAAGACAAACACGTAAATACACAAA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179081 TAAAATTAAAAATTATATGTAATTGAATAAAATTTAAAGACAAACACGTAAATACACAAA 9179140 Query 541 AACTGAAGGACTAAGTAGGTTAGTTTCATAGAAAGTAAATACAGAGCAGACAAGAGTCAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179141 AACTGAAGGACTAAGTAGGTTAGTTTCATAGAAAGTAAATACAGAGCAGACAAGAGTCAG 9179200 Query 601 TAATTGATTTCAGTTCAATTTGCACACAAGCATTAACGAAGCTGATGTGACTCAACTGCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179201 TAATTGATTTCAGTTCAATTTGCACACAAGCATTAACGAAGCTGATGTGACTCAACTGCA 9179260 Query 661 AGAGTTAAATGCCATTTGATGGTGGTTGAAAGTTTAATTAATTTCAAGAACTCGTAATAA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179261 AGAGTTAAATGCCATTTGATGGTGGTTGAAAGTTTAATTAATTTCAAGAACTCGTAATAA 9179320 Query 721 TTACTCCATTGCATATAAGACATCCTAGGATTATTAAATTATTTCACTAATTTATTTATG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179321 TTACTCCATTGCATATAAGACATCCTAGGATTATTAAATTATTTCACTAATTTATTTATG 9179380 Query 781 ATTCTAACACTTTATACTTATGGTTGAAAAGTGCTTCATTTATAATTACTTACATATGCT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179381 ATTCTAACACTTTATACTTATGGTTGAAAAGTGCTTCATTTATAATTACTTACATATGCT 9179440 Query 841 AAAAAACAAATTGTTTGTTTTTTGTTTTTGGGTCAATCTGACATGATGGTGTGATGGTAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179441 AAAAAACAAATTGTTTGTTTTTTGTTTTTGGGTCAATCTGACATGATGGTGTGATGGTAA 9179500 Query 901 TATGTTGAAAATCTCGAGGTCGAACTTTAAGACGAGTTCTTTATATATATATATGTGTGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179501 TATGTTGAAAATCTCGAGGTCGAACTTTAAGACGAGTTCTTTATATATATATATGTGTGT 9179560 Query 961 ATGTGTGTGTGTGAAGTTCTTGAATACCATACAAAAATTTCAACTTCATCTGTCAGCCAT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179561 ATGTGTGTGTGTGAAGTTCTTGAATACCATACAAAAATTTCAACTTCATCTGTCAGCCAT 9179620 Query 1021 GCAGAACTTGGCATTTTCACGCATCACTATCAAACCATCTGCAAGAACGCCACCTGGCTT 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179621 GCAGAACTTGGCATTTTCACGCATCACTATCAAACCATCTGCAAGAACGCCACCTGGCTT 9179680 Query 1081 CAACAACCCACCGAAAAAACATGCTGGATTCCTCCGCCGGCACCTACTACCACCCGTCAC 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179681 CAACAACCCACCGAAAAAACATGCTGGATTCCTCCGCCGGCACCTACTACCACCCGTCAC 9179740 Query 1141 AGCGGCGCCAGCGCCGTTACGATACCAAACGTGCACCAATCAAGAAGACTCAATGCCACC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179741 AGCGGCGCCAGCGCCGTTACGATACCAAACGTGCACCAATCAAGAAGACTCAATGCCACC 9179800 Query 1201 GGAGAAAGTTGAAGTCTTTAAATCGTTGGAGAATTGGGCATCCCACCGGGTCCTACCGTT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179801 GGAGAAAGTTGAAGTCTTTAAATCGTTGGAGAATTGGGCATCCCACCGGGTCCTACCGTT 9179860 Query 1261 ACTCAAACCCGTCGAAAAATCCTGGCAACCCATTGATTTTCTCCCGAACCCGGCTCAAAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179861 ACTCAAACCCGTCGAAAAATCCTGGCAACCCATTGATTTTCTCCCGAACCCGGCTCAAAA 9179920 Query 1321 TTCGGAGGATTTCGCCGACGAAGTCCGCCAGTTGCGTGAACGGACTTCTCAACTTCCCGA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179921 TTCGGAGGATTTCGCCGACGAAGTCCGCCAGTTGCGTGAACGGACTTCTCAACTTCCCGA 9179980 Query 1381 TGACTACTTTGTGGTGCTCGTCGGTGACATGATCACCGAAGAAGCTCTGCCTACTTACCA 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9179981 TGACTACTTTGTGGTGCTCGTCGGTGACATGATCACCGAAGAAGCTCTGCCTACTTACCA 9180040 Query 1441 GAGCATGTTGAACAGATTCGACGGCATTCGTGACGAAACCGGTGCTAGTCCTTCCCCTTG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180041 GAGCATGTTGAACAGATTCGACGGCATTCGTGACGAAACCGGTGCTAGTCCTTCCCCTTG 9180100 Query 1501 GGCTTCTTGGATTCGTTCTTGGACTGCCGAAGAAAATAGACATGGCGATTTACTTCGTAC 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180101 GGCTTCTTGGATTCGTTCTTGGACTGCCGAAGAAAATAGACATGGCGATTTACTTCGTAC 9180160 Query 1561 TTATCTCTATCTTTCCGGTAGAGTTGACATGCAGATGATTGACCGGACAATCCAATTCTT 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180161 TTATCTCTATCTTTCCGGTAGAGTTGACATGCAGATGATTGACCGGACAATCCAATTCTT 9180220 Query 1621 GATTAGCTCTGGGATGGTAACGTTACATACCCCATTTGATCAATTTTCATTTGAACAAAA 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180221 GATTAGCTCTGGGATGGTAACGTTACATACCCCATTTGATCAATTTTCATTTGAACAAAA 9180280 Query 1681 TAATATTTGAGTAATTATTATTATTTAATTTGTTTGTGATATTAATTAATTAGGACACTG 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180281 TAATATTTGAGTAATTATTATTATTTAATTTGTTTGTGATATTAATTAATTAGGACACTG 9180340 Query 1741 GAATAGCGAAAAATCCATATTTAGGATTTGTGTACACATCATTTCAAGAGCGAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180341 GAATAGCGAAAAATCCATATTTAGGATTTGTGTACACATCATTTCAAGAGCGAGCCACAT 9180400 Query 1801 TCGTGTCACATGGAAACACGGCTCGGCTAGCCAAGGAAGGCGGGGATCCAGTGCTTGCGA 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180401 TCGTGTCACATGGAAACACGGCTCGGCTAGCCAAGGAAGGCGGGGATCCAGTGCTTGCGA 9180460 Query 1861 GGATATGCGGTACGATTGCAGCCGACGAGAAGCGTCACGAGAACGCTTACTCTATGGTAT 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180461 GGATATGCGGTACGATTGCAGCCGACGAGAAGCGTCACGAGAACGCTTACTCTATGGTAT 9180520 Query 1921 TTGAAAAATTACTGGAAGTAGATCCGAATGGTGCCATGCTGGCAATAGGTGATATGATGA 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180521 TTGAAAAATTACTGGAAGTAGATCCGAATGGTGCCATGCTGGCAATAGGTGATATGATGA 9180580 Query 1981 GAAAGAAAATCAAAATGCCAGCTCATCTCATGTACGACGGACAGGATCCTAATTTGTTCG 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180581 GAAAGAAAATCAAAATGCCAGCTCATCTCATGTACGACGGACAGGATCCTAATTTGTTCG 9180640 Query 2041 AGCACTTCGCCGCCGTCACTCAACGTCTCGGAGTTTACACCGCCGGCGACTATGCTGACA 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180641 AGCACTTCGCCGCCGTCACTCAACGTCTCGGAGTTTACACCGCCGGCGACTATGCTGACA 9180700 Query 2101 TCCTTGAGTTCTTGATTGGGCGGTGGAATTTGGAAAAGATTCAAGGCTTGACGGCTGAAG 2160 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180701 TCCTTGAGTTCTTGATTGGGCGGTGGAATTTGGAAAAGATTCAAGGCTTGACGGCTGAAG 9180760 Query 2161 CTAATTCTGCACAGGACTTTGTTTGTGGGCTGCCACCTAGGATGAGGAAGTTGCAAGGGA 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180761 CTAATTCTGCACAGGACTTTGTTTGTGGGCTGCCACCTAGGATGAGGAAGTTGCAAGGGA 9180820 Query 2221 GAGCCGATCAGCGAGCCAAGAAGCTGCAGCCTAAAGGGGTTAAATTTAGCTGGATCTTTA 2280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180821 GAGCCGATCAGCGAGCCAAGAAGCTGCAGCCTAAAGGGGTTAAATTTAGCTGGATCTTTA 9180880 Query 2281 ATAAGGAAGTGGTTTTCTGATCTTTTCTTTACTGGGGGGTTCGAATTGAATATAACAGAA 2340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180881 ATAAGGAAGTGGTTTTCTGATCTTTTCTTTACTGGGGGGTTCGAATTGAATATAACAGAA 9180940 Query 2341 TATTTGGGGGTATATTTGAAACTTAAGTTTTGTTGTATACTGACAGAACAATTTTACCAT 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9180941 TATTTGGGGGTATATTTGAAACTTAAGTTTTGTTGTATACTGACAGAACAATTTTACCAT 9181000 Query 2401 ATATATCTGTAATATTATATGATAAATAAAACTATAGTTTCTATTCTAATTATTATTATT 2460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9181001 ATATATCTGTAATATTATATGATAAATAAAACTATAGTTTCTATTCTAATTATTATTATT 9181060 Query 2461 ATAAAAGACTAAAGTAACATTGCATTAAGGTAAATACAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGA 2520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9181061 ATAAAAGACTAAAGTAACATTGCATTAAGGTAAATACAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGA 9181120 Query 2521 AAAACGCAAAACGCGAAACACAAGTTTTTGTTTTTATAGGTTGGCCCCACATATTCTGCA 2580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9181121 AAAACGCAAAACGCGAAACACAAGTTTTTGTTTTTATAGGTTGGCCCCACATATTCTGCA 9181180 Query 2581 TGCATTTAATTCAAGTCCCACAAAATAAAATTTTCACAAATATAGCTCCTTATTAAAGAT 2640 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9181181 TGCATTTAATTCAAGTCCCACAAAATAAAATTTTCACAAATATAGCTCCTTATTAAAGAT 9181240 Query 2641 CCAGCTAAATTTCACTCCAGTCGTGGTCCGGAGCTTCTTGGCTCGCTCGTCAGCTTTCTC 2700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9181241 CCAGCTAAATTTCACTCCAGTCGTGGTCCGGAGCTTCTTGGCTCGCTCGTCAGCTTTCTC 9181300 Query 2701 TTGTAACCTCCTCATCCTAGGAGCTAGTCCACACACGAACTCTTGTGCACGTCTCGCATC 2760 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9181301 TTGTAACCTCCTCATCCTAGGAGCTAGTCCACACACGAACTCTTGTGCACGTCTCGCATC 9181360 Query 2761 ATCCGTCAAACCCTCGAGCTTCTCTAATCTCCACCGTTGA 2800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9181361 ATCCGTCAAACCCTCGAGCTTCTCTAATCTCCACCGTTGA 9181400 Score = 547 bits (296), Expect = 7e-154 Identities = 848/1116 (76%), Gaps = 32/1116 (3%) Strand=Plus/Minus Query 1194 TGCCACCGGAGAAAGTTGAAGTCTTTAAATCGTTGGAGAATTGGGCATCCCACCGGGTCC 1253 |||||||||| |||||| || ||||||| || | || ||||||| |||| |||| Sbjct 9182332 TGCCACCGGAAAAAGTTCAAATCTTTAAGTCACTAGAATCTTGGGCAACCCAAAATGTCC 9182273 Query 1254 TACCGTTACTCAAACCCGTCGAAAAATCCTGGCAACCCATTGATTTTCTCCCGAACCCGG 1313 | || | ||||||||||| || ||||| |||||||||| || || ||||||||||||| Sbjct 9182272 TTCCCCTTCTCAAACCCGTTGAGAAATCATGGCAACCCACCGAATTCCTCCCGAACCCGG 9182213 Query 1314 CTCAAAATTCGGAGGATTTCGCCGACGAAGT-C-CGCCAGTTGCGTGAACGGACTTCTCA 1371 |||| |||| || |||||| |||| ||||| | |||| | ||| | || || || | Sbjct 9182212 CTCAGAATTTCGATGATTTCACCGAAGAAGTTCGCGCC--CTCCGTCACCGTACCTCCGA 9182155 Query 1372 ACTTCCCGATGACTACTTTGTGGTGCTCGTCGGTGACATGATCACCGAAGAAGCTCTGCC 1431 ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||| |||| Sbjct 9182154 TCTTCCCGATGAGTACTTGGTCGTTCTTGTCGGTGACATGATTACGGAAGAAGCATTGCC 9182095 Query 1432 TACTTACCAGAGCATGTTGAACAGATTCGACGGCATTCGTGACGAAACCGGTGCTAGTCC 1491 ||||| || || ||| | |||||| | |||||| || || || || || ||| || | Sbjct 9182094 AACTTATCAAAGTATGATTAACAGACTTGACGGCGTTAAGGATGAGACGGGAGCTTGTAC 9182035 Query 1492 TTCCCCTTGGGCTTCTTGGATTCGTTCTTGGACTGCCGAAGAAAATAGACATGGCGATTT 1551 ||||||||||||| ||||| || ||||||| || |||||||| | || |||||||| Sbjct 9182034 TTCCCCTTGGGCTATTTGGACACGAGCTTGGACGGCGGAAGAAAACCGTCACGGCGATTT 9181975 Query 1552 ACTTCGTACTTATCTCTATCTTTCCGGTAGAGTTGACATG-CAGATGATTGACCGGACAA 1610 ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||||||| || | Sbjct 9181974 ACTCAAGACTTATCTTTACCTTTCCGGCAGAGTTGACATGACA-ATGATTGACAAAACTA 9181916 Query 1611 TCCAATTCTTGATTAGCTCTGGGATGGTAACGTTAC---A-TAC-C---CCATTT-GA-- 1659 |||||| || |||| || || |||||| |||| | | | | | | |||| || Sbjct 9181915 TCCAATATTTACTTAGTTCCGGCATGGTA-CGTTTCTTAATTTCGCTTTCAATTTCGAGC 9181857 Query 1660 TCAATTT--TCATTTGAACAAAATAATATTTGA-GTAATTATTATTATTTAATTTGT-TT 1715 |||||| ||| || |||||| || |||| | || || || ||| ||| | | Sbjct 9181856 CCAATTTGGTCAATT---CAAAAT-TTA-TTGACTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTATCCT 9181802 Query 1716 GTGATATTAATTAATTA-GGACACTGGAATAGCGAAAAATCCATATTTAGGATTTGTGTA 1774 | | |||||||||| | | ||||| | | | |||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 9181801 TT-TTGGTAATTAATTAAGAATACTGGTACAAATAGAAATCCCTATTTTGGATTTGTGTA 9181743 Query 1775 CACATCATTTCAAGAGCGAGCCACATTCGTGTCACATGGAAACACGGCTCGGCTAGCCAA 1834 ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| Sbjct 9181742 CACGTCATTCCAAGAGCGAGCCACATTTGTGTCACATGGTAATACGGCTCGGCTCGCCAA 9181683 Query 1835 GGAAGGCGGGGATCCAGTGCTTGCGAGGATATGCGGTACGATTGCAGCCGACGAGAAGCG 1894 ||| | |||||||| ||||| || | |||||| ||| | |||||| ||||||||||||| Sbjct 9181682 GGAGAGAGGGGATCCTGTGCTAGCCAAGATATGTGGTTCAATTGCATCCGACGAGAAGCG 9181623 Query 1895 TCACGAGAACGCTTACTCTATGGTATTTGAAAAATTACTGGAAGTAGATCCGAATGGTGC 1954 ||||||| |||||||| | | | || |||||| | ||||| ||||||| || || Sbjct 9181622 CCACGAGAGTGCTTACTCGAGAATCGTCGAGAAATTAGTCGAAGTGGATCCGAGCGGAGC 9181563 Query 1955 CATGCTGGCAATAGGTGATATGATGAGAAAGAAAATCAAAATGCCAGCTCATCTCATGTA 2014 |||| | || |||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||||| ||||| Sbjct 9181562 CATGTTAGCCATAGGTGAAATGATGAGAATGAAAATTACAATGCCGGCTCATCTAATGTA 9181503 Query 2015 CGACGGACAGGATCCTAATTTGTTCGAGCACTTCGCCGCCGTCACTCAACGTCTCGGAGT 2074 |||||| || ||||| ||| |||||| || ||| | || || | ||||| ||||| || Sbjct 9181502 CGACGGCCAAGATCCGAATCTGTTCGCTCATTTCTCGGCTGTAGCCCAACGACTCGGGGT 9181443 Query 2075 TTACACCGCCGGCGACTATGCTGACATCCTTGAGTTCTTGATTGGGCGGTGGAATTTGGA 2134 ||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| || || Sbjct 9181442 TTATACTGCCGGAGATTATGCAGACATTCTTGAATTTTTAATTCAACGGTGGAGATTAGA 9181383 Query 2135 AAAGATTCAAGGCTTGACGGCTGAAGCTAATTCTGCACAGGACTTTGTTTGTGGGCTGCC 2194 ||| | | || ||||||| ||| || | |||||| || || || ||||| || | Sbjct 9181382 GAAGCTCGAGGGTTTGACGGATGATGCGAGACGTGCACAAGAGTTCGTGTGTGGACTAGC 9181323 Query 2195 ACCTAGGATGAGGAAGTTGCAAGGGAGAGCCGATCAGCGAGCCAAGAAGCT--GCAGC-C 2251 ||||||||||||| ||| |||| || ||| || |||||||||||||||| | | | | Sbjct 9181322 TCCTAGGATGAGGAGGTTACAAGAGAAAGCTGACGAGCGAGCCAAGAAGCTCCGGACCAC 9181263 Query 2252 TAAAGGGGTTAAATTTAGCTGGATCTTTAATAAGGA 2287 | || || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9181262 GACTGGAGTGAAATTTAGCTGGATCTTTAATAAGGA 9181227 Score = 86.1 bits (46), Expect = 7e-15 Identities = 98/123 (80%), Gaps = 3/123 (2%) Strand=Plus/Minus Query 2627 TCCTTATTAAAGATCCAGCTAAATTTCACTCCAGTCGTGGTCCGGAGCTTCTTGGCTCGC 2686 |||||||||||||||||||||||||| || || | | | | | ||||||||||||||| Sbjct 9180887 TCCTTATTAAAGATCCAGCTAAATTTAACCCCTTTAG-GCTGC--AGCTTCTTGGCTCGC 9180831 Query 2687 TCGTCAGCTTTCTCTTGTAACCTCCTCATCCTAGGAGCTAGTCCACACACGAACTCTTGT 2746 | || ||| || |||| ||| ||||||||||||| | || ||||| || || || ||| Sbjct 9180830 TGATCGGCTCTCCCTTGCAACTTCCTCATCCTAGGTGGCAGCCCACAAACAAAGTCCTGT 9180771 Query 2747 GCA 2749 ||| Sbjct 9180770 GCA 9180768 >HiC_scaffold_1 Length=19001867 Score = 86.1 bits (46), Expect = 7e-15 Identities = 193/266 (73%), Gaps = 2/266 (1%) Strand=Plus/Minus Query 1374 TTCCCGATGACTACTTTGTGGTGCTCGTCGGTGACATGATCACCGAAGAAGCTCTGCCTA 1433 |||| |||||||| ||||| ||| | || || || ||||| || || ||||| || || | Sbjct 8587134 TTCCTGATGACTATTTTGTTGTGTTAGTTGGAGATATGATTACAGAGGAAGCACTTCCAA 8587075 Query 1434 CTTACCAGAGCATGTTGAACAGATTCGACGGCATTCGTGACGAAACCGGTGCTAGTCCT- 1492 ||||||||| ||| | || | | || || |||| ||||| || ||||| || ||| Sbjct 8587074 CTTACCAGACAATGCTTAATACCCTTGATGGAGTTCGAGACGAGACAGGTGCCAG-CCTA 8587016 Query 1493 TCCCCTTGGGCTTCTTGGATTCGTTCTTGGACTGCCGAAGAAAATAGACATGGCGATTTA 1552 | |||||||| ||||| | | | |||||||| || || ||||| ||||| || | Sbjct 8587015 ACTTCTTGGGCTATTTGGACTAGGGCATGGACTGCAGAGGAGAATAGGCATGGTGACCTC 8586956 Query 1553 CTTCGTACTTATCTCTATCTTTCCGGTAGAGTTGACATGCAGATGATTGACCGGACAATC 1612 ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||| || Sbjct 8586955 CTTAACAAATATCTTTATCTTTCTGGTAGAGTTGATATGAGGCAGATTGAAAAGACGATT 8586896 Query 1613 CAATTCTTGATTAGCTCTGGGATGGT 1638 || | | | ||| ||||||| ||||| Sbjct 8586895 CAGTACCTTATTGGCTCTGGCATGGT 8586870 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 571226253444 Database: Asclepias_curassavica_genome_v1.0.fasta Posted date: Jun 11, 2021 2:01 PM Number of letters in database: 206,076,041 Number of sequences in database: 213 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5